Nuckelflaschenkaries zeigt sich typischerweise zuerst an den oberen Schneidezähnen, da die Schneidezähne des Unterkiefers beim Trinken durch die darüberliegende Zunge geschützt sind. Erste Symptome sind kreidig-weiße oder bräunliche Flecken auf den Zähnen. Mit der Zeit dringt die Karies tiefer in den Zahn ein und zersetzt ihn. Es zeigen sich auffällige, dunkel verfärbte Löcher im Zahn, und die Erkrankung kann von den Schneidezähnen auf das gesamte Gebiss übergreifen.
Kariöse Zähne reagieren oft empfindlich auf Süßes und Kälte. Deshalb können betroffene Kinder Schmerzen beim Essen und Trinken haben. Im Spätstadium kann Nuckelflaschenkaries die befallenen Zähne vollkommen zerstören und bis an den Zahnnerv vordringen. Weiterhin können auch schmerzhafte eitrige Schwellungen (Abszesse) im Bereich der Zahnwurzeln entstehen.
