Typisches Symptom eines Gerstenkorns ist eine plötzlich auftretende Schwellung am oberen oder unteren Augenlid. Die Schwellung ist schmerzhaft und befindet sich zumeist nah am Wimpernkranz. In manchen Fällen ist das komplette Augenlid gerötet und geschwollen. Es können auch gelbliche Eiterbläschen zu sehen sein.

Folgende Symptome können ebenfalls auftreten:
- Juckreiz im betroffenen Bereich
- Fremdkörpergefühl im Auge
- Druckempfindliches Augenlid
- Tränendes Auge
- Verschwommene Sicht
- Schmerzen beim Blinzeln
- Gelbes Sekret auf den Wimpern
- Augenlid spannt und ist geschwollen
- Augenlid kann hängend wirken
Zu unterscheiden ist das Gerstenkorn von einem Hagelkorn. Wirkt die Schwellung verkapselt und heilt nicht ab, kann es sich um ein Hagelkorn handeln. Im Unterschied zu einem Gerstenkorn ist ein Hagelkorn nicht ansteckend und es verursacht in der Regel keine Schmerzen.